Rok akademicki 2011/2012 rozpoczyna się 1 października 2011 roku i trwa do 30 września 2012 roku. Dzieli się na dwa semestry:

- zimowy - od 1 października 2011 roku do 22 lutego 2012 roku

- letni - od 23 lutego 2012 roku do 30 września 2012 roku.

Terminy zajęć dydaktycznych:

• od 2 października 2011 roku do 21 grudnia 2011 roku
• od 3 stycznia 2012 roku do 27 stycznia 2012 roku
• od 23 lutego 2012 roku do 5 kwietnia 2012 roku
• od 11 kwietnia 2012 roku do 15 czerwca 2012 roku

• Zimowa: od 28 stycznia 2012 roku do 8 lutego 2012 roku
• Zimowa poprawkowa: od 16 lutego 2012 roku do 22 lutego 2012 roku
• Letnia: od 16 czerwca 2012 roku do 28 czerwca 2012 roku
• Letnia poprawkowa: od 1 września 2012 roku do 15 września 2012 roku

• Przerwa świąteczna: od 22 grudnia 2011 roku do 2 stycznia 2012 roku
• Przerwa semestralna: od 9 lutego 2012 roku do 15 lutego 2012 roku
• Przerwa świąteczna: od 6 kwietnia 2012 roku do 10 kwietnia 2012 roku
• Przerwa wakacyjna: od 29 czerwca 2012 roku do 30 września 2012 roku

• 2 maja 2012 roku
  
• piątek w tygodniu, w którym odbywają się Juwenalia
  

Rektor może, na uzasadniony wniosek dziekana wydziału zaopiniowany przez Wydziałową Radę Samorządu Studentów, zmienić termin sesji egzaminacyjnej, o ile zagwarantowana zostanie realizacja pełnego programu nauczania i planu studiów.

Dziekan wydziału - z ważnych powodów - może ustanowić dodatkowe godziny wolne od zajęć.

Dziekani zobowiązani są do zapewnienia pełnej realizacji planowanych godzin zajęć dydaktycznych. Do zrealizowania wskazanego w programie nauczania i planie studiów wymiaru godzin wykorzystane mogą zostać metody i techniki kształcenia na odległość (e-learning). Prowadzenie zajęć z wykorzystaniem metod i technik kształcenia na odległość regulują odrębne przepisy

Okres od 16 do 30 września 2012 roku przeznaczony jest na załatwianie spraw organizacyjnych związanych z zakończeniem roku akademickiego 2011/2012 i rozpoczęciem roku akademickiego 2012/2013.

Szczegółową organizację roku akademickiego w Collegium Medicum ustala prorektor UJ ds. Collegium Medicum.

Szczegółową organizację roku akademickiego dla poszczególnych kierunków studiów niestacjonarnych ustala dziekan wydziału w oparciu o obowiązujące plany i programy studiów.

Z dniem 30 września 2011 roku traci moc zarządzenie nr 19 Rektora Uniwersytetu Jagiellońskiego z 7 kwietnia 2010 roku w sprawie organizacji roku akademickiego 2010/2011.

Zarządzenie wchodzi w życie z dniem 1 października 2011 roku.