Medal "Merentibus" przyznaje się z tytułu szczególnych zasług dla UJ. Medal może być przyznany osobie, organizacji lub instytucji zarówno z kraju, jak i z zagranicy. Wyjątkowo Medal "Merentibus" można przyznać również pracownikowi Uniwersytetu Jagiellońskiego. Decyzję w sprawie przyznania medalu podejmuje (na wniosek Rektora) Senat UJ w drodze uchwały.
W razie przyznania medalu dokonuje się odpowiedniego wpisu do Księgi Odznaczonych z uzasadnieniem podjętej decyzji. Wręczenia medalu dokonuje Rektor w czasie uroczystości akademickich. Wraz z medalem wręcza się wyróżnionemu dyplom oraz uroczyście odczytuje treść wpisu do Księgi Odznaczonych.
Regulamin przyznawania medalu "Merentibus"
Medal "Merentibus" otrzymali:
w 2019 roku:
- Profesor Mario Suwalsky
w 2018 roku:
- Profesor Wacław Uruszczak
w 2014 roku:
- Profesor Ralph Jozefowicz
w 2013 roku:
- Uniwersytet Fryderyka Schillera w Jenie
w 2012 roku:
- Profesor Benjamin Michael Chain
- Profesor Cheong Byung Kwon
w 2011 roku:
- Profesor Michael Marberger
w 2009 roku:
- Profesor Franciszek Ziejka
- Uniwersytet Ruprechta Karola w Heidelbergu
- Uniwersytet w Bochum
w 2008 roku:
- The Catholic University of America
- Uniwersytet w Orleanie
- Uniwersytet Wiedeński
w 2007 roku:
- Profesor Piotr Sztompka
- Miasto Kraków
- Hartmut Machner
- Andrzej Tarczyński
w 2006 roku:
- Profesor Claudine Kieda
- Profesor Stanisław Grodziski
w 2004 roku:
- Profesor Gunnar Boehner
- Profesor Antoni Dziatkowiak
- Kolegiata Akademicka Św. Anny
- Fundacja im. Aleksandra von Humboldta
w 2003 roku:
- Profesor Tadeusz Popiela
- Profesor Alfred Schauer
- Profesor Ryszard Gryglewski
w 2002 roku:
- Profesor Krystyna Dyrek
w 2001 roku:
- Profesor Stanisław Waltoś
- Profesor Jean Castel