Tytuł Profesora Honorowego nadaje Senat Uniwersytetu Jagiellońskiego na wniosek Rektora, po zasięgnięciu opinii Konwentu Godności Honorowych.
Regulamin nadawania tytułu profesora honorowego Uniwersytetu Jagiellońskiego
Tytułem Profesora Honorowego Uniwersytetu Jagiellońskiego uhonorowani zostali:
w roku 2003
- prof. Krystyna DYREK (Wydział Chemii)
- prof. Ralph JÓZEFOWICZ (Wydział Lekarski)
- prof. Stanisław PENCZEK (Wydział Chemii)
- prof. Kazimierz POLAŃSKI (Wydział Filologiczny)
- prof. Adam STRZAŁKOWSKI (Wydział Fizyki, Astronomii i Informatyki Stosowanej)
- prof. Józef WOLSKI (Wydział Historyczny)
w roku 2005
- prof. Adam BIELAŃSKI (Wydział Chemii)
w roku 2006
- prof. dr hab. Andrzej HRYNKIEWICZ (Wydział Fizyki, Astronomii i Informatyki Stosowanej)
w roku 2007
- prof. dr hab. Antoni JACKOWSKI (Wydział Biologii i Nauk o Ziemi)
w roku 2009
- prof. dr hab. Andrzej BIAŁAS (Wydział Fizyki, Astronomii i Informatyki Stosowanej)
- prof. dr hab. Andrzej STARUSZKIEWICZ (Wydział Fizyki, Astronomii i Informatyki Stosowanej)
w roku 2010
- prof. dr hab. Andrzej PELCZAR (Wydział Matematyki i Informatyki)
w roku 2012
- prof. dr hab. Stanisław WALTOŚ (Wydział Prawa i Administracji)
- prof. dr hab. Franciszek ZIEJKA (Wydział Polonistyki)
w roku 2013
- prof. Jacek KLINOWSKI (Wydział Chemii UJ / Uniwersytet w Cambridge)
w roku 2014
- prof. dr hab. Janusz K. KOZŁOWSKI (Wydział Historyczny)
w roku 2018
- prof. dr hab. Andrzej ZOLL (Wydział Prawa i Administracji)
w roku 2019
- prof. dr hab. Jacek DUBIEL (Wydział Lekarski)
w roku 2021
- prof. dr hab. Piotr SZTOMPKA (Wydział Filozoficzny)
w roku 2022
- prof. dr hab. Jan WOLEŃSKI (Wydział Filozoficzny)