Utrwalony niezwykle głęboko w tradycji Almae Matris Jagellonicae zwyczaj wyróżniania doktoratem honorowym sięga swymi początkami drugiego dziesięciolecia XIX wieku. Na jego pojawienie się i regulaminowe utrwalenie wpływały bezpośrednio - jak wolno przypuszczać - wzory obce płynące z wszechnic niemieckich i austriackich. Powołując się na nie domagał się Uniwersytet już w marcu i kwietniu 1815 roku w Dyrekcji Edukacji Narodowej w Warszawie uprawnień do "dawania zaszczytu doktoratu mężom, którzy się w świecie literackim wsławili przez pisma swoje uczone i pożyteczne, które to dyplomata nazywają się honorifica, dla rozróżnienia ich od tych, które drogą zwyczajną udzielane bywają".

Poczet

2021

• prof. Marek Krawczyk
• Olga Tokarczuk
• prof. Reiner Schmidt
• prof. Wojciech Żurek

2019

• prof. Sir Leszek Borysiewicz
• prof. Nico van Straalen

2018

• prof. Joseph Schatzker
• prof. Jacques Leroy
• Tad Taube

2017

• prof. Maria Delaperrière

2016

• prof. Larry McLerran
• prof. Yukihiro Ozaki

2015

• prof. Henryk Samsonowicz
• prof. Anthony Giddens, Baron Giddens
• prof. Luigi Marinelli
• prof. Henning Dralle

2014

• prof. Robert Huber
• prof. Witold Kieżun
• prof. Antony Polonsky

2013

• prof. Maciej Żylicz
• prof. Franz H. Messerli
• prof. Andrzej Grzegorczyk

2012

• ks. prof. Michał Heller
• prof. Frank Wilczek
• prof. Wacław Szybalski
• Adam Zagajewski

2011

• Gaetano Platania
• Peter-Christian Müller-Graff
• Thomas L. Saaty
• Hans Joachim Meyer

2010

• Andrzej Murzynowski
• Henryk Olszewski

2009

• Marek Edelman
• Andrzej Ciechanowiecki
• Jan A. Staessen
• Rudi Van Eldik

2008

• Lonny Glaser
• Jan Baszkiewicz
• Frank Steglich
• Jego Świątobliwość Dalajlama, Tenzin Gyatso
• Andrzej Szczeklik

2007

• Richard Wielebinski

2006

• Czesław Olech
• Stanisław Barańczak

2005

• Aleksander Koj
• Seamus Heaney
• Bronisław Geremek
• Józef J. Ziółkowski
• ks. abp Józef Życiński

2004

• Joachim Treusch
• Frederica P. Perera
• Ryszard Kapuściński

2003

• Kardynał Franz Koenig
• Władysław Stróżewski
• Norman Davies

2002

• Peter Hommelhoff
• Horst Konzen
• Isabella Lugoski-Karle
• Jerome Karle
• Umberto Veronesi

2001

• James Travis

2000

• Daniel Beauvois
• Zbigniew K. Brzeziński
• Michel Che
• Karl Dedecius
• François Delange
• Michał Głowiński
• Kornel Gibiński
• Henryk Mikołaj Górecki
• Gustaw Herling-Grudziński
• Jerzy Jarocki
• Franciszek Kokot
• ks. kardynał Franciszek Macharski
• Peter Mansfield
• Pietro Marchesani
• Mirosław Mossakowski
• Sławomir Mrożek
• Jerzy Nowosielski
• Jan Nowak Jeziorański
• Stanisław Stomma
• Michał Szwarc
• Władysław Świątecki
• Andrzej Tarkowski
• Andrzej Trzebski Tomas Venclova
• Piotr Wandycz
• Tadeusz Różewicz

1999

• Stephen Holgate

1998

• Krzysztof Penderecki
• Stanisław Lem
• Heinz Schuster Šewc

1997

• William J. Norwood

1996

• Aleksander Gieysztor
• Daria Haust
• Eugene Donald Jacobson
• Robert G. Parr
• Gisbert zu Putlitz

1995

• Jaakko Hintikka
• Friedrich Koja
• Gerard Labuda

1994

• Szymon Wiesenthal

1993

• Berthold Beitz
• Matka Teresa z Kalkuty

1992

• Giulio Andreotti
• Edward Raczyński

1991

• Jean Baptiste Duroselle
• Albin Eser
• Jerzy Giedroyć

1990

• Józef Maria Bocheński
• Jerzy Turowicz
• Joachim Werner

1989

• Marie Thérese d'Alverny
• Alois Haas
• James Steward Hyde
• Robert K. Merton
• Czesław Miłosz
• Wiktor Skopenko
• Stefan Świeżawski
• Andrzej Wajda
• Henryk Wereszycki

1988

• Paul Raabe

1987

• Wacław Szubert

1986

• Sante Graciotti

1985

• Kazimierz Przybyłowski
• Jan Safarewicz
• Władysław Wolter

1984

• Raymond Firth
• Witold Lutosławski
• Andreas G. Papandreu
• Javier Pérez de Cuéllar

1983

• Jego Świątobliwość Papież Jan Paweł II
• Rene Jean Dupuy
• Karolina Lanckorońska
• Teodor Parnicki

1981

• Andor Csizmadia
• Julian Godlewski
• Ilia Prigogine

1980

• Henryk Jabłoński

1979

• Jarosław Iwaszkiewicz

1978

• Torgn Segerstedt

1977

• Andrzej Burda

1976

• Fiedot Filin
• Jacques le Goff

1975

• Otto Bihari
• Marian Mięsowicz
• Feliks Topolski
• Anatol Aleksandrowicz Nicziporowicz
• Michaił Sołomonowicz Strogowicz
• Clement John Zabłocki

1974

• Zdenek Kopal
• Edward Piszek

1973

• Claude Backvis
• Vojtech Filkorn
• Jerzy Kuryłowicz
• Konrad Górski
• Bohuslav Havránek

1968

• Władysław Tatarkiewicz

1967

• Tadeusz Ważewski

1966

• Ignacio Chávez

1964

• Ivo Andrić
• William Bloom
• Giacomo Devoto
• Jean Gaudement
• Stanisław Kaleśnik
• Piotr Leonidowicz Kapica
• Józef Klima
• Tadeusz Kotarbiński
• Roman Kozłowski
• Julian Krzyżanowski
• Philip Henry Kuenen
• Ernest Labrousse
• Oskar Lange
• Erik Molnár
• Wiktor Niemycki
• Linus Pauling
• Borys Aleksandrowicz Rybakow
• Wojciech Rubinowicz
• Maksym Rylski
• Kazimierz Tymieniecki
• Eduardo Volterra
• Adam Wrzosek
• Wiktor M. Żyrmunski

1962

• Clementino Francisco de Santiago Dantas
• Jan Olbrycht
• Władysław Szafer

1960

• Wojciech Świętosławski

1958

• Adam Krzyżanowski

1954

• Ludwik Solski

1951

• Irene Joliot-Curie
• Frédéric Joliot-Curie

1949

• Leopold Staff

1948

• Julije Beneąić
• Franciszek Popiołek
• Fryderyk Zoll

1947

• Adolf Černý
• Juliusz Ippoldt
• Józef Kostrzewski
• Eugeniusz Romer
• Jan Stach

1938

• Pietro de Francisci
• Stanisław Kutrzeba

1934

• Henryk Hoyer

1933

• Adam Chmiel

1931

• Leopold Adametz
• Teodor Filip Kubina

1930

• Władysław Natanson
• Karol Szymanowski
• Tadeusz Zieliński

1929

• Emil Godlewski (junior)
• Arkadiusz Lisiecki
• Stanisław Zaremba

1928

• Leon Marchlewski
• Albert Thomas

1927

• Gabriel Bertrand
• Emil Godlewski (senior)

1926

• Józef Boguski
• Stanisław Okoniewski
• Adam Sapieha
• Julian Talko-Hryncewicz

1924

• Maria Skłodowska-Curie
• Henryk Hoyer
• Kazimierz Kostanecki

1923

• Henryk Le Rond

1922

• Artur Balfour
• Władysław Mickiewicz

1920

• Józef Piłsudski

1919

• Herbert Hoover
• Ignacy Paderewski

1918

• Ignacy Chrzanowski
• Ferdynand Foch
• Dezydery Mercier
• Leon Sternbach
• Thomas Woodrow Wilson

1914

• Ludwik Ćwikliński
• Alfred Sokołowski

1910

• Jan Łoś
• Józef Morozewicz

1908

• Witold Korytowski

1900

• Guido Baccelli
• Ignacy Baranowski
• Joachim Berthier
• Leon Biliński
• Michał Bobrzyński
• Eugen Böhm von Bawerk
• Abraham Bredius
• Ernest Commer
• Dominik Comparetti
• Borys Cziczerin
• Rudolf Dareste
• Yves Delage
• Leopold Delisle
• Henryk Denifle
• Ludwik Duchesne
• Paweł Duhem
• Ernest Dümmler
• Julian Dunajewski
• Roland Eötvös
• Jan Gebauer
• Ludwik Górski
• Wilhelm Hartel
• Jarosław Hlava
• Józef Hlavka
• Władysław Holewiński
• Henryk Hoyer (senior)
• Karol Inama von Sternegg
• Watrosław Jagić
• Feliks Klein
• Nikodem Kondokow
• Henryk Kossowski
• Radowan Koąutić
• Juliusz Kühn
• Stanisław Kujot
• Zygmunt Laskowski
• Franciszek Laurin
• Henryk Lebesgue
• Mieczysław Ledóchowski
• Edward Likowski
• Józef Lister
• Tadeusz Lubomirski
• Władysław Łuszczkiewicz
• Fryderyk Maitland
• Alfred Marshall
• Marceli Nencki
• Szymon Newcomb
• Konstanty Nigra
• Adolf Nordenskiöld
• Ludwik Parocchii
• Adolf Perraud
• Leon Piniński
• Jan Puzyna
• Aleksander Pypin Wilhelm Ramsay
• Antoni Randa
• Ferdynand Regelsberger
• Ludwik Renault
• Emil Roux
• Henryk Sienkiewicz
• Mikołaj Sklifosowski
• Karol de Smedt
• Włodzimierz Spasowicz
• Henryk Struve
• Edward Süss
• Heliodor Święcicki
• Józef Thomson
• Paweł Violet
• Rudolf Virchow
• Tadeusz Wojciechowski

1898

• Izaak Issakowicz

1892

• Antoni Małecki
• August Witkowski

1891

• Józef Majer

1888

• Salvatore Talamo

1887

• August Cieszkowski
• Ignacy Domeyko
• Paweł Gautsch-de Frankethurn
• Rudolf Habsburg
• Julian Klaczko
• Jan Ignacy Korytkowski
• Adam Krasiński
• Józef Supiński
• Jan Matejko
• Seweryn Morawski
• Michał Nowodworski
• Wiktor Szokalski
• Władysław Taczanowski

1885

• Albin Dunajewski

1884

• Karol Rokitansky

1883

• Hilary Hankiewicz
• Stanisław Spis

1879

• Józef Kraszewski

1872

• Adam Adamowicz
• Józef Szujski

1867

• Ferdynand Skibiński
• Józef Brodowicz

1866

• Franciszek Karliński

1862

• Franciszek Maciejowski

1859

• Emil Czyrniański
• Wiktor Zepharowich

1851

• Antoni Szymański

1850

• Wincenty Pol
• Jan Staroniewicz

1848

• Karol Heylman

1847

• Józef Brodowicz
• Władysław Endlicher
• Jan Zienkiewicz

1846

• August Schilling

1845

• Sebastian Brunner

1844

• Christian Fryderyk Harles

1843

• Jan de Reuman

1842

• Karol Heintl

1840

• Jan Schindler

1837

• Herman Czech
• Franciszek Stachowski
• Mateusz Gładyszewicz

1833

• Jan Chrzciciel Schindler
• Maksymilian Weisse

1832

• Michał Wiszniewski

1830

• Władysław Starczewski

1829

• Ludwik Łętowski
• Wojciech Ossoliński

1826

• Edward Czarnecki
• Norbert Alfons Kumelski

1824

• Mateusz Maurycy Wojakowski

1821

• Józef Gołuchowski
• Kajetan Trojański

1820

• Joachim Lelewel

1819

• Józef Celiński
• Jan Marcel Gutkowski
• Fryderyk Skarbek
• Kalasanty Szaniawski
• Józef Szczepan Koźmian

1818

• Mikołaj Corde
• Ignacy Miączyński
• Ernest Reibnitz
• Wojciech Anzelm Szweykowski
• Antoni Tafiłowski

1816

• Feliks Bentkowski
• Paweł Czajkowski