Nagroda "Pro Arte Docendi" indywidualna bądź zespołowa, przyznawana jest z okazji inauguracji roku akademickiego w Uniwersytecie Jagiellońskim. Nagrodę przyznaje się wybitnym nauczycielom akademickim zatrudnionym w UJ za wysoką jakość pracy dydaktycznej, a w szczególności mistrzostwo w sztuce przekazywania wiedzy, doskonałe relacje i wyniki pracy ze studentami, indywidualną pracę z wyróżniającymi się wychowankami oraz kołami naukowymi, wprowadzanie nowatorskich rozwiązań w zakresie kształcenia oraz stosowanie w praktyce innowacyjnych metod i środków, zgodnych ze wskazaniami nowoczesnej dydaktyki akademickiej.

W roku akademickim 2018/2019 Nagrodę otrzymali:

• prof. Andrzej Herdegen - Wydział Fizyki, Astronomii i Informatyki Stosowanej;
• dr hab. Kamilla Małek - Wydział Chemii;
• dr Piotr Prokopowicz - Wydział Filozoficzny;
• dr hab. Tomasz Kaczmarzyk - Wydział Lekarski.

W roku akademickim 2017/2018 Nagrodę otrzymali:

• prof. Anna Janus-Sitarz - Wydział Polonistyki;
• prof. Jan Andrzej Litwin - Wydział Lekarski;
• dr hab. Joanna Grela - Wydział Filozoficzny;
• dr hab. Lech Sokołowski - Wydział Fizyki, Astronomii i Informatyki Stosowanej.

W roku akademickim 2016/2017 Nagrodę otrzymali:

• prof. Marek Jarnicki - Wydział Matematyki i Informatyki;
• prof. Kazimierz Lankosz - Wydział Prawa i Administracji ;
• dr Renata Iwicka - Wydział Filozoficzny;
• dr Michał Nowakowski - Wydział Lekarski.

W roku akademickim 2015/2016 Nagrodę otrzymali:

• dr hab. Anna Sajdak - Wydział Filozoficzny;
• dr hab. Joanna Bereta - Wydział Biochemii, Biofizyki i Biotechnologii;
• dr hab. Paweł Góra - Wydział Fizyki, Astronomii i Informatyki Stosowanej;
• prof. Jerzy Walocha - Wydział Lekarski.

W roku akademickim 2014/2015 Nagrodę otrzymali:

• prof. Marek Sanak - Wydział Lekarski;
• prof. Ryszard Laskowski - Wydział Biologii i Nauk o Ziemi;
• prof. Stanisława Surdykowska - Wydział Zarządzania i Komunikacji Społecznej;
• prof. Andrzej Borowski - Wydział Polonistyki.

W roku akademickim 2013/2014 Nagrodę otrzymali:

• prof. dr hab. Jolanta Jaworek - Wydział Nauk o Zdrowiu;
• dr Krzysztof Ciesielski - Wydział Matematyki i Informatyki.

W roku akademickim 2012/2013 Nagrodę otrzymali:

• prof. Jacek S. Dubiel - Wydział Lekarski;
• prof. Andrzej Zoll - Wydział Prawa i Administracji;
• dr Krzysztof Kowalski - Wydział Studiów Międzynarodowych i Politycznych;
• dr Paweł Czubik - Wydział Studiów Międzynarodowych i Politycznych.

W roku akademickim 2011/12 Nagrodę otrzymali:

• prof. Elżbieta Muskat-Tabakowska - Wydział Filologiczny;
• prof. Stanisław Majewski - Wydział Lekarski;
• prof. Andrzej Magiera - Wydział Fizyki, Astronomii i Informatyki Stosowanej.

W roku akademickim 2010/11 Nagrodę otrzymali:

• dr hab. Krzysztof Zamorski - Wydział Historyczny;
• prof. dr hab. Krzysztof Krajewski - Wydział Prawa i Administracji;
• dr Beata Kowalska - Wydział Filozoficzny

W roku akademickim 2009/2010 Nagrodę otrzymali:

• dr hab. Bartłomiej Dobroczyński - Wydział Filozoficzny;
• red. Andrzej Magdoń  - Wydział Zarządzania i Komunikacji Społecznej
• nagroda zespołowa: dr hab. Marek Frankowicz, dr Anna Kolasa - Wydział Chemii;

W roku akademickim 2008/09 Nagrodę otrzymali:

• prof. dr hab. Krzysztof Łukasz Kaczanowski - Wydział Biologii i Nauk o Ziemi;
• prof. dr hab. Krzysztof Ożóg - Wydział Historyczny;

W roku akademickim 2007/08 Nagrodę otrzymali:

• prof. dr hab. Danuta Karcz - Wydział Lekarski;
• prof. dr hab. Ewa Miodońska - Brookes - Wydział Polonistyki;
• prof. dr hab. Antoni Pędziwiatr - Wydział Fizyki, Astronomii i Informatyki Stosowanej;

W roku akademickim 2006/07 Nagrodę otrzymali:

• prof. dr hab. Jerzy Ombach - Wydział Matematyki i Informatyki;
• prof. dr hab. Teresa Adamek-Guzik - Wydział Lekarski;
• prof. dr hab. Lucjan Suchanek - Wydział Studiów Międzynarodowych i Politycznych;

W roku akademickim 2005/06 Nagrodę otrzymali:

• nagroda zespołowa dla dr hab. Renaty Jachowicz, prof. dr. hab Jerzego Brandysa - Wydział Farmaceutyczny;
• dr Aleksandra Patalas - Wydział Historyczny;
• dr hab. Janusz Jamrozik, prof. UJ - Wydział Chemii;

W roku akademickim 2004/2005 Nagrodę otrzymali:

• prof. dr hab. Tomasz Gizbert-Studnicki - Wydział Prawa i Administracji;
• prof. dr hab. Paweł Idziak - Wydział Matematyki i Informatyki;
• prof. dr hab. Jacek Pietrzyk - Wydział Lekarski;

W roku akademickim 2003/2004 Nagrodę otrzymali:

• prof. dr hab. Tadeusz Cichocki - Wydział Lekarski;
• prof. dr hab. Andrzej Staruszkiewicz - Wydział Fizyki, Astronomii i Informatyki Stosowanej;
• dr Krzysztof Szczerski - Wydział Studiów Międzynarodowych i Politycznych.