Nagroda "Pro Arte Docendi" indywidualna bądź zespołowa, przyznawana jest z okazji inauguracji roku akademickiego w Uniwersytecie Jagiellońskim. Nagrodę przyznaje się wybitnym nauczycielom akademickim zatrudnionym w UJ za wysoką jakość pracy dydaktycznej, a w szczególności mistrzostwo w sztuce przekazywania wiedzy, doskonałe relacje i wyniki pracy ze studentami, indywidualną pracę z wyróżniającymi się wychowankami oraz kołami naukowymi, wprowadzanie nowatorskich rozwiązań w zakresie kształcenia oraz stosowanie w praktyce innowacyjnych metod i środków, zgodnych ze wskazaniami nowoczesnej dydaktyki akademickiej.
W roku akademickim 2018/2019 Nagrodę otrzymali:
- prof. Andrzej Herdegen - Wydział Fizyki, Astronomii i Informatyki Stosowanej;
- dr hab. Kamilla Małek - Wydział Chemii;
- dr Piotr Prokopowicz - Wydział Filozoficzny;
- dr hab. Tomasz Kaczmarzyk - Wydział Lekarski.
W roku akademickim 2017/2018 Nagrodę otrzymali:
- prof. Anna Janus-Sitarz - Wydział Polonistyki;
- prof. Jan Andrzej Litwin - Wydział Lekarski;
- dr hab. Joanna Grela - Wydział Filozoficzny;
- dr hab. Lech Sokołowski - Wydział Fizyki, Astronomii i Informatyki Stosowanej.
W roku akademickim 2016/2017 Nagrodę otrzymali:
- prof. Marek Jarnicki - Wydział Matematyki i Informatyki;
- prof. Kazimierz Lankosz - Wydział Prawa i Administracji ;
- dr Renata Iwicka - Wydział Filozoficzny;
- dr Michał Nowakowski - Wydział Lekarski.
W roku akademickim 2015/2016 Nagrodę otrzymali:
- dr hab. Anna Sajdak - Wydział Filozoficzny;
- dr hab. Joanna Bereta - Wydział Biochemii, Biofizyki i Biotechnologii;
- dr hab. Paweł Góra - Wydział Fizyki, Astronomii i Informatyki Stosowanej;
- prof. Jerzy Walocha - Wydział Lekarski.
W roku akademickim 2014/2015 Nagrodę otrzymali:
- prof. Marek Sanak - Wydział Lekarski;
- prof. Ryszard Laskowski - Wydział Biologii i Nauk o Ziemi;
- prof. Stanisława Surdykowska - Wydział Zarządzania i Komunikacji Społecznej;
- prof. Andrzej Borowski - Wydział Polonistyki.
W roku akademickim 2013/2014 Nagrodę otrzymali:
- prof. dr hab. Jolanta Jaworek - Wydział Nauk o Zdrowiu;
- dr Krzysztof Ciesielski - Wydział Matematyki i Informatyki.
W roku akademickim 2012/2013 Nagrodę otrzymali:
- prof. Jacek S. Dubiel - Wydział Lekarski;
- prof. Andrzej Zoll - Wydział Prawa i Administracji;
- dr Krzysztof Kowalski - Wydział Studiów Międzynarodowych i Politycznych;
- dr Paweł Czubik - Wydział Studiów Międzynarodowych i Politycznych.
W roku akademickim 2011/12 Nagrodę otrzymali:
- prof. Elżbieta Muskat-Tabakowska - Wydział Filologiczny;
- prof. Stanisław Majewski - Wydział Lekarski;
- prof. Andrzej Magiera - Wydział Fizyki, Astronomii i Informatyki Stosowanej.
W roku akademickim 2010/11 Nagrodę otrzymali:
- dr hab. Krzysztof Zamorski - Wydział Historyczny;
- prof. dr hab. Krzysztof Krajewski - Wydział Prawa i Administracji;
- dr Beata Kowalska - Wydział Filozoficzny
W roku akademickim 2009/2010 Nagrodę otrzymali:
- dr hab. Bartłomiej Dobroczyński - Wydział Filozoficzny;
- red. Andrzej Magdoń - Wydział Zarządzania i Komunikacji Społecznej
- nagroda zespołowa: dr hab. Marek Frankowicz, dr Anna Kolasa - Wydział Chemii;
W roku akademickim 2008/09 Nagrodę otrzymali:
- prof. dr hab. Krzysztof Łukasz Kaczanowski - Wydział Biologii i Nauk o Ziemi;
- prof. dr hab. Krzysztof Ożóg - Wydział Historyczny;
W roku akademickim 2007/08 Nagrodę otrzymali:
- prof. dr hab. Danuta Karcz - Wydział Lekarski;
- prof. dr hab. Ewa Miodońska - Brookes - Wydział Polonistyki;
- prof. dr hab. Antoni Pędziwiatr - Wydział Fizyki, Astronomii i Informatyki Stosowanej;
W roku akademickim 2006/07 Nagrodę otrzymali:
- prof. dr hab. Jerzy Ombach - Wydział Matematyki i Informatyki;
- prof. dr hab. Teresa Adamek-Guzik - Wydział Lekarski;
- prof. dr hab. Lucjan Suchanek - Wydział Studiów Międzynarodowych i Politycznych;
W roku akademickim 2005/06 Nagrodę otrzymali:
- nagroda zespołowa dla dr hab. Renaty Jachowicz, prof. dr. hab Jerzego Brandysa - Wydział Farmaceutyczny;
- dr Aleksandra Patalas - Wydział Historyczny;
- dr hab. Janusz Jamrozik, prof. UJ - Wydział Chemii;
W roku akademickim 2004/2005 Nagrodę otrzymali:
- prof. dr hab. Tomasz Gizbert-Studnicki - Wydział Prawa i Administracji;
- prof. dr hab. Paweł Idziak - Wydział Matematyki i Informatyki;
- prof. dr hab. Jacek Pietrzyk - Wydział Lekarski;
W roku akademickim 2003/2004 Nagrodę otrzymali:
- prof. dr hab. Tadeusz Cichocki - Wydział Lekarski;
- prof. dr hab. Andrzej Staruszkiewicz - Wydział Fizyki, Astronomii i Informatyki Stosowanej;
- dr Krzysztof Szczerski - Wydział Studiów Międzynarodowych i Politycznych.